1.宗庙中藏放祖先神主的屋室。《左传。庄公十四年》：「典司宗祏。」晋。杜预。注：「宗祏，宗庙中藏主石室。」《新唐书。卷一三。礼乐志三》：「建石室于寝园以藏神主，至褅、祫之岁则祭之。」
2.古代藏书的地方。《史记。卷一三○。太史公自序》：「周道废，秦拨去古文，焚灭诗书，故明堂石室、金匮玉版，图籍散乱。」《汉书。卷一。高帝纪下》：「丹书铁契，金匮石室，藏之宗庙。」
3.石洞。《后汉书。卷八六。南蛮西南夷列传。南蛮》：「槃瓠得女，负而走入南山，止石室中。所处险绝，人迹不至。」三国魏。曹植〈苦思行〉：「郁郁西岳巅，石室青葱与天连。」
4.石造的屋室，比喻防守非常坚固。《三国志。卷六五。吴书。王楼贺韦华传。贺邵》：「近刘氏据三关之险，守重山之固，可谓金城石室。」
5.石造的坟墓。《宋书。卷一五。礼志二》：「汉以后，天下送死奢靡，多作石室、石兽、碑、铭等物。」

水经注容峰之东有仙人石室学者经过往往闻讽诵之音矣

盘瓠的遗迹。晋。鲍坚《说郛。卷六一。武陵记。武山》：「武山高可万仞，山半有盘瓠石窟，中有一石狗形，云是盘瓠之遗像。」

汉代宫中藏书的地方。《后汉书。卷六六。王允传》：「允悉收敛兰台石室图书、秘纬要者以从。」《幼学琼林。卷四。文事类》：「典籍储藏，皆在兰台石室。」参见「兰台」条。

地名。甘肃省敦煌县东南鸣沙山半腹地山麓有石室无数，俗称为「千佛洞」，旧称为「莫高窟」。于前秦苻坚建元二年由僧人乐僔凿建经营。内藏六朝、隋、唐及五代人手写佛教经典及其他艺术品甚富，对中国文学艺术影响颇钜。清光绪二十六年发现，所藏多为英人斯坦因及法人伯希和先后择要蒐罗而去，今藏伦敦博物馆和巴黎国民图书馆。也称为「敦煌千佛洞」、「敦煌石窟」。

朱庆馀 古观诗 仙观曾过知不远，花藏石室杳难寻。

传说群鬼聚居处。《神异经·中荒经》：“东北有鬼星石室，三百户共一门，石牓，题曰‘鬼门’。”

古代国家秘藏重要文书的地方。《史记。卷一三○。太史公自序》：「迁为太史令，䌷史记、石室金匮之书。」也作「金匮石室」。

见“ 石室金匱 ”。

古代国家秘藏重要文书的地方。《史记。卷一三○。太史公自序》：「迁为太史令，䌷史记、石室金匮之书。」也作「金匮石室」。

神僧传竺昙猷移始丰赤城山石室坐禅有猛虎数十蹲在猷前猷诵经如故一虎独睡猷以如意扣虎头问何不听经俄而群虎皆去

江总 明庆寺诗 金河知證果，石室乃安禅。

周 代宗庙藏远祖之神主的地方。《说文·示部》：“祏，宗庙主也。 周 礼有郊宗石室。” 段玉裁 注：“郊宗石室，盖谓天子有之……远祖之宔为石室藏之。至祭上帝於南郊，祭五帝於明堂，则奉其宔以配食，故谓之郊宗石室。” 清 龚自珍 《五经大义终始论》：“郊宗石室以建之主，兼礼备乐以存之统。”

比喻险固的城池。《三国志·吴志·贺邵传》：“近 刘氏 据三关之险，守重山之固，可谓金城石室，万世之业。”

古代国家秘藏重要文书的地方。《汉书。卷一。高帝纪下》：「又与功臣剖符作誓，丹书铁契，金匮石室，藏之宗庙。」宋。陆游 会稽志序：「上参禹贡，下考太史公及历代史金匮石室之藏，旁及《尔雅》、《本草》、《道释》之书。」也作「石室金匮」。